細胞培養技術與其他一般實驗室工作的主要區別在于要求保持無菌操作，避免微生物及其他有害因素的影響。目前，超凈工作臺的廣泛使用，很大程度上方便了組織細胞培養工作，并使一些常規實驗室有可能用于進行細胞培養。
細胞培養實驗室應能進行六方面的工作：無菌操作、孵育、制備、清洗、消毒滅菌處理、儲藏。
因此，無論是動物細胞培養室還是植物細胞培養實驗室，必定有一下幾種房間。
①洗滌間：根據工作量的大小決定其大小。在實驗室的一側設置專用的洗滌水槽，用來清洗玻璃器皿。中央實驗臺還應配置水槽，用于清洗小型玻璃器皿。如果工作量大，可以購置一臺洗瓶機。準備洗液缸，專門用于洗滌對潔凈度要求很高的玻璃器皿。此外還應配置落水架、干燥箱、柜子、超聲波清洗器等。地面應耐濕并排水良好。
②培養基配制間：配備的主要儀器設備有：冰箱、天平、微波爐、pH計、培養基分裝器、藥品柜、器械柜、抽氣泵、電爐、各種規格的培養瓶、培養皿、移液管、燒杯、量筒、容量瓶、儲藏瓶等。
?③消毒間：配備實驗臺、高壓滅菌鍋、排風滅火設備、細菌過濾設備、干熱消毒柜、電爐等。?滅菌鍋的選擇應根據不同的要求選擇不同型號的滅菌鍋。一般實驗室可選用小型的醫用手提式高壓滅菌鍋，較大的實驗室可選用立式自動控制壓力和溫度的滅菌鍋。生產性的實驗室可選用大型的臥式滅菌鍋。如果沒有條件的話，可以將上述工作間合并成一個準備間，要求是設備的安裝和排列要合理、房間要寬敞、明亮、透風，地面要便于清潔、防滑。?
④無菌操作室：無菌操作室主要用于實驗材料的接種操作，所以又叫接種室。通常由里外兩間組成，外間是緩沖間，用于準備工作，還有防止污染的作用。緩沖間的門應該與接種室的門錯開，兩個門也不要同時開啟，以保證無菌室不因開門和人的進出帶進雜菌。緩沖間內應該設有水槽、實驗臺、鞋帽架、和柜子、紫外燈。無菌操作室的內壁應當用塑鋼板或瓷磚裝修，工作人員進入操作間前要穿上消過毒的工作服和拖鞋。室內應配有超凈工作臺，紫外燈、解剖鏡、各種接種器械等。
⑤培養室。
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