潔凈室的換氣次數不合理
換氣次數、壓差、懸浮粒子數是潔凈室三項最基本的要求，潔凈室不論是亂流時的稀釋作用，還是單相流時的置換作用，都需靠潔凈空氣的量來控制和實現潔凈室的各種參數，因此潔凈室的換氣次數不能過低。
不宜采用上送上回方式
由于歷史原因個別潔凈室仍采用上送上回的送回風方式。上送上回最大的好處是造價低，節約資金，但它至少會出現下面幾種情況：
（1）在一定高度（例如呼吸帶）上5μm大微粒較多，往往以0.5μm衡量達到標準，而以5μm衡量則達不到標準。
（2）如果是局部百級的場合，則工作區的風速往往很小，很難達到標準。
（3）自凈時間較長，實測表明自凈時間可以長出1倍。上送上回方式雖然在某些空態測定中可能達到設計潔凈度級別，但在動態是很不利于排除污染，是不宜推薦的方式。
局部百級存在問題
有的企業沒有安裝局部百級前生產質量上無大問題，而安裝了局部百級后，產品的某些指標如澄明度反而下降，廢品率大大增加。產生此類現象主要有以下幾種原因：
（1）高效過濾器質量不合格，出廠時未經過逐臺檢驗，有漏洞。
（2）高效過濾器安裝質量不合格，既高效過濾器不是向下或向上靠螺桿壓在框架上的橡膠密封墊上，而是擰在風口壁上的自攻螺絲上，只能越吹越松。
（3）單相流的氣流速度小，發生污染以后不能馬上被排走。
（4）局部單向流與背景非單向流送風口的設計不合理，非單向流送風口離集中送風口較近，對集中送風口下的單向流肯定有干擾作用，如果非單向流送風口布置在集中送風口一側，而另一側只有單側回風口，則對局百干擾更大，特別是下風向一側受到影響更大。
（5）生產人員未完全執行潔凈工作制度，自身攜帶的污染物（如潔凈服有污染、未戴無菌帽、口罩等）被加速吹向生產線。
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